創祀は建保3年（1215）との説もありますが、縁起では文安4年（1447）となっています。
昔、折居婆さん（おりんという説も）が、鴎島で白髪の老人から瓶子（とっくり）を授けられ、それを投げるとニシンが採れるようになると教えられて、その通りにやってみると、ニシンが郡来たという伝説があります。その折居婆さんが信仰していた３つの神様を祀ったのが、この神社の始まりです。
折居婆さんを祀る折居社跡地が、アネロイド気圧計のある通りに残されています。
また、折居婆さんが投げた瓶子は、鴎島そばの「瓶子岩」となったのだそう。
例祭は8月11日で、10日から江差の町中を山車行列が巡る「姥神大神宮渡御祭」は、今からおよそ350年前から始まったという、北海道の中でも最も古い歴史を持つお祭です。
祭神：
天照大御神(あまてらすおおみかみ)
天児屋根命(あめのこやねのみこと)
住吉三柱大神(すみよしのみはしらおおかみ)
